RNA免疫沉淀技術(RIP)是一種研究RNA與蛋白質相互作用的重要方法,其應用領域主要包括:
1. 轉錄后調控研究:RIP技術可以幫助研究者了解RNA在轉錄后水平如何被調控。
2. 表觀遺傳調控:RIP技術用于研究RNA結合蛋白(RBPs)在表觀遺傳調控中的作用。
3. 非編碼RNA功能研究:RIP技術可以用來研究長非編碼RNA(lncRNA)、miRNA和其他小RNA的種類,以及它們如何與蛋白質相互作用來調控基因表達。
4. RNA病毒研究:RIP技術也可用于研究RNA病毒與其宿主細胞內蛋白質的相互作用,進而了解病毒復制和致病機制。
5. RNA修飾和甲基化研究:RIP技術結合其他技術如m5C-RIP-seq,可用于研究RNA甲基化修飾及其在病理過程中的作用。
6. RNA定位和穩定性:通過RIP技術,研究者可以探索特定RNA在細胞內的定位以及它們如何被穩定或降解。
7. RNA-蛋白質復合物的鑒定:RIP技術可以用來鑒定與特定RNA結合的蛋白質,從而揭示RNA-蛋白質復合物的組成。
8. 疾病相關RNA研究:RIP技術在疾病相關RNA的研究中也有應用。
免疫沉淀技術Co-IP的實驗設計。廣州IP免疫沉淀實驗原理
ChIP技術的應用:
1. 轉錄因子結合位點的鑒定:研究特定轉錄因子在基因組上的結合模式。
2. 組蛋白修飾的分布:分析不同組蛋白修飾在基因組上的分布情況,這些修飾與基因的活躍或沉默有關。
3. DNA甲基化研究:結合ChIP技術可以研究DNA甲基化對基因表達的影響。
4. 染色質結構和功能:研究染色質重塑對基因表達和細胞功能的影響。
5. 疾病相關基因的調控:研究疾病狀態下基因調控網絡的變化。
ChIP技術是表觀遺傳學研究中的一個重要工具,它可以幫助科學家們理解基因表達是如何在分子水平上被精確調控的。
北京IP免疫沉淀磁珠現貨免疫沉淀技術RIP的實驗方法。
ChIP(染色質免疫沉淀)實驗是一種用于研究蛋白質與DNA相互作用的技術。以下是ChIP實驗的實驗設計概述:
1. 目標蛋白的選擇:確定您想要研究的目標蛋白,例如特定的轉錄因子或組蛋白修飾。
2. 樣本的準備:根據研究的需要選擇合適的細胞或組織樣本。
3. 抗體的選擇:選擇具有高特異性和親和力的抗體,這對于實驗的成功至關重要。
4. 交聯:使用甲醛等交聯劑將蛋白質與DNA在體內共價結合,形成穩定的蛋白質-DNA復合物。
5. 細胞裂解:裂解細胞以釋放染色質,同時保持蛋白質-DNA復合物的完整性。
6. 染色質的剪切:通過超聲或酶消化將染色質剪切成適當大小的片段,通常在200-1000 bp之間。
7. 免疫沉淀:使用特定抗體與目標蛋白結合,然后利用蛋白A/G磁珠沉淀復合物。
8. 洗滌和洗脫:洗滌沉淀物以去除未特異性結合的蛋白質和DNA,然后洗脫目標蛋白-DNA復合物。
9. 逆轉交聯:使用蛋白酶K處理樣品以逆轉交聯,釋放DNA。
10. DNA的純化和分析:純化DNA并使用qPCR、芯片或測序技術(如ChIP-seq)進行分析。
免疫沉淀實驗步驟:
1. 樣品制備
a. 懸浮細胞樣品處理:離心收集細胞(4℃, 1000g, 5 min),用手指把細胞用力彈散。按照6孔板每孔細胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應在使用前數分鐘內加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)。混勻后置于冰上處理10 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
b. 貼壁細胞樣品處理:移去培養基,用PBS清洗細胞兩遍;用細胞刮棒刮脫細胞,收集至1.5mL EP管內,按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應在使用前數分鐘內加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)。吹打數下,使裂解液和細胞充分接觸。混勻后置于冰上處理10 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
4. 后續:磁珠預處理——抗體吸附——抗原結合反應——抗體洗脫
免疫沉淀技術的實驗設計。
免疫沉淀是利用抗體特異性反應純化富集目的蛋白的一種方法。抗體與細胞裂解液或表達上清中相應的蛋白結合后,再與蛋白A/G(ProteinA/G)或二抗偶聯的珠子(agarose或Sepharose)孵育,通過離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復合物,沉淀經過洗滌后,重懸于電泳上樣緩沖液,煮沸5-10min,在高溫及還原劑的作用下,抗原與抗體解離,離心收集上清,上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白。免疫沉淀是一種生物學技術,它利用抗體的特異性結合特性來富集和分離混合物中的特定蛋白質。這種技術是研究蛋白質表達、蛋白質-蛋白質相互作用、蛋白質修飾和蛋白質功能的強大工具。免疫沉淀Co-IP技術選瓊脂糖珠還是磁珠?蘇州anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠哪個公司好用
免疫沉淀技術Co-IP的原理是什么?廣州IP免疫沉淀實驗原理
免疫沉淀RIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構 (直徑 50-150 μm) 可以結合抗體 (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優勢。
廣州IP免疫沉淀實驗原理